Il Museo Nicolaiano di Bari, inaugurato il 6 febbraio del 2010, raccoglie i tesori e le testimonianze della storia della basilica di San Nicola. È parte integrante della omonima cittadella insieme al Centro studi Nicolaiani. Centro di grande rilevanza per chiunque sia interessato alla storia del Santo e della città di Bari, partendo dall’antichità, attraversa diverse epoche: bizantina (876-1071), normanna (1071-1194), sveva (1194-1266), angioina (1266-1442), aragonese (1442-1501), vicereale (1551-1734), borbonica (1734-1861) e postunitaria. Tra i capolavori custoditi si annoverano epigrafi, pergamene e codici miniati, provenienti dal prezioso Archivio della basilica, oltre a smalti, stemmi, reliquiari, calici e argenti, provenienti dal Tesoro, dipinti e paramenti sacri.