Il Museo espone reperti che vanno dalla preistoria fino all’età tardoantica, emersi nelle necropoli di Altamura, Gravina in Puglia, Toritto, Cassano delle Murge, Ginosa e Laterza, grazie ai quale è possibile ricostruire la storia delle diverse civiltà che si sono succedute nel tempo in quest’area. Di notevole interesse è la sezione dedicata all’Uomo di Altamura, uno scheletro intero di Neanderthal scoperto il 3 ottobre 1993, rinvenuto in località Lamalunga, vissuto tra i 128.000 e i 187.000 anni fa (Pleistocene medio-superiore). Una certa attenzione va inoltre rivolta alla mostra permanente “Preistoria del cibo. Alle origini del pane” che fornisce una descrizione dei processi produttivi legati al pane: uno degli alimenti più essenziali nella dieta dell’uomo, dalla preistoria ad oggi.