Le notizie più datate del complesso risalgono alla bolla, emanata nel 1432 da papa Eugenio IV, con la quale il pontefice concesse al vescovo e all'Università di Bitetto di costruire il convento. L’aspetto attuale è il risultato di numerosi restauri, sulla facciata barocca troneggia la statua della Madonna degli Angeli, devozione particolarmente cara ai Francescani. L’interno è diviso in tre navate mediante pilastri, particolarmente pregiato l'altare in legno dorato, intagliato dal famoso frate-scultore Giuseppe da Soleto. La chiesa custodisce le spoglie incorrotte del Beato Giacomo da Bitetto, originario dell’Illiria, morto in odore di santità nella cittadina pugliese.